NGS Approach for Variant Discovery in Giant Freshwater Prawn An NGS approach to mine SNP from the amplicons of Macrobrachium rosenbergii
-
- Englisch ausgewählt
46,99 €
UVP
54,90 €
inkl. gesetzl. MwSt.,
Beschreibung
Produktdetails
Einband
Taschenbuch
Erscheinungsdatum
10.10.2019
Verlag
LAP LAMBERT Academic PublishingSeitenzahl
88
Maße (L/B/H)
22/15/0,6 cm
Gewicht
149 g
Auflage
1. Auflage
Sprache
Englisch
ISBN
978-620-0-44005-1
Amongst farmed crustaceans, the giant freshwater prawn Macrobrachium rosenbergii was until recently one of the major species with high commercial value. Lately, it has lost popularity due to diseases and differential growth of males on account of social hierarchy. The species can reacquire its former preferred status if it is genetically improved for growth and disease resistance. Selective breeding is greatly facilitated by marker-assisted selection (MAS). Single nucleotide polymorphisms (SNPs) offer the finest resolution possible for a marker map (a single nucleotide change), are co-dominant, bi-allelic and generally abundant in populations with a low mutation rate. DNA sequencing through NGS platforms is regarded as the most cost-effective approach. In this study, SNP mining was carried out in the transcribed sequences of M. rosenbergii available in GenBank, NCBI. Wild specimens were collected from different water bodies. Primers were designed to amplify coding (CDS) and sequenced the amplicons on GS-FLX 454 and Ion torrent platforms. 173 SNPs were detected across populations. This approach for mining SNPs in reported sequences has been used by us for the first time.
Noch keine Bewertungen vorhanden
Verfassen Sie die erste Bewertung zu diesem Artikel
Helfen Sie anderen Kundinnen und Kunden durch Ihre Meinung.
Kurze Frage zu unserer Seite
Vielen Dank für Ihr Feedback
Wir nutzen Ihr Feedback, um unsere Produktseiten zu verbessern. Bitte haben Sie Verständnis, dass wir Ihnen keine Rückmeldung geben können. Falls Sie Kontakt mit uns aufnehmen möchten, können Sie sich aber gerne an unseren Kund*innenservice wenden.
zum Kundenservice